Cette espèce est l'une des plus anciennement décrite. Elle est endémique du Vénézuela, où on la trouve au nord, au niveau de la chaine cotière et plus au sud, dans les montagnes voisines de Merida vers 1200 m d'altitude.

La végétation est de petite taille (moins de 10 cm de haut).
La fleur se caractérise par un synsépale de petite taille (15 mm de long sur 5 de large), jaune pâle, légèrement marqué de stries rouge brun à la base. Le labelle est petit, de 5 mm de long sur 1,5 de large. Il n'est pas fimbrié comme celui de Restrepia trichoglossa , avec laquelle Restrepia wageneri est souvent confondue.

L'espèce est apparemment rare en collection, la plupart des R. wageneri en culture étant en réalité des R. trichoglossa à synsépale strié.